از مهمترین آسیب‌‌هایی که عموماً باغ‌ها را تهدید می‌کنند، تخریب و الحاقات غیر اصولی و نامناسبی است که در طول زمان در آنها حادث می‌شوند. باغ شاهزاده کرمان نیز هرچند از زیباترین و قابل توجه ترین باغ‌های باقی مانده است، از این آسیب‌ها بدور نمانده بود. در این پروژه ضمن ارائه طرح‌های مرمت، جلوگیری از تجاوزات به بستر باغ مدنظر بوده است.